Baltijos jūra yra jauniausia jūra pasaulyje, o jos ekosistema – viena iš unikaliausių jūrinių ekosistemų Žemėje. Unikalumą iš dalies lemia tai, kad Baltijos jūros vanduo yra tik apysūris, t.y. jis druskingesnis nei gėlas upių vanduo. Daugumos kitų jūrų vanduo yra žymiai druskingesnis nei Baltijos.

Baltijos jūra vis dar pasižymi gana didele biologine įvairove, nors dalis rūšių nyksta. Gyvena čia pilkasis ruonis, žieduotasis ruonis, jūrų kiaulė, migruodami du kartus per metus čia sustoja milijonai poliarinių žuvėdrų, ledinių ančių, galima sužvejoti menkių, silkių, lašišų.

Tačiau Baltijos jūra yra ir viena labiausiai kenčiančių jūrų pasaulyje. Pagrindinės problemos, nuo kurių pastaraisiais dešimtmečiais kenčia Baltijos jūra, yra žuvų išgaudymas, naftos išsiliejimai ir tarša iš supančių teritorijų, ypač pernelyg didelis patenkančių maistinių medžiagų – azoto ir fosforo junginių – kiekis ir su tuo susijusi eutrofikacija. Daugiau apie šias problemas rasite pasirinkę temas kairėje.